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© Pierre Gounon
Virus influenza purifié, agent de la grippe. Ce virus enveloppé possède un génome fragmenté : 8 segments d'ARN négatif protégés par une nucléocapside.

Présentation

Metagenomics methods provide public health sciences with the ability to detect a plethora of known and unknown viromes in clinical samples. In this context, Next-generation sequencing (NGS) technologies have a tremendous impact, taking into account currently available and possible future platforms and bioinformatics. The massive data produced by NGS presents a significant challenge for data analysis and management. As such, advanced bioinformatic tools have become essential for the successful application of NGS technology.

Projets

CV

(EN)

Professional Experience

June 2006 – June 2012 : Mass-Spectrometry Proteomics and Genomics Bio-informatics – Systems Biology Lab, Institut Pasteur, Paris.

May 2005 – May 2006 : Post-doc Bio-informatics — Ecole Normale Supérieure, Paris.

May 2004 – May 2005 : Post-doc Systems Biology — University Basel, Switzerland.

Education

Ph.D. (March 2004), computer science, Laboratoire bordelais de Recherche en Informatique (LABRI, Université de Bordeaux I, France), and Institut National de Recherche en Informatique et Automatique (I.N.R.I.A. Rocquencourt, France).

“Algorithms and statistical metrics or assessing the significance of functional motifs in biological regulatory sequences.” – Promotors: Dr. M. Régnier, Prof. Dr. S. Dulucq).

M.Sc. (June 2000), Laboratory of Protein Biochemistry and Protein Engineering, University of Ghent, Belgium.

“Cloning and expression of the Chlorobium limicola forma thiosulfatophylum cytochrome c-551 gene and its influence in the thio- sulfate consuming gene-cluster” – Promoteurs: Prof. Dr. J. Van Beeumen, Dr. ir. F. Verté; Laboratory for  Biochemistry, microbiology et physiology.

Publications