Contexte
Milieu Interieur (MI) est une étude de cohorte financée par le LabEx dans le but de définir les caractéristiques d’une réponse immunitaire saine et d’identifier les déterminants génétiques et environnementaux de la variabilité immunitaire. Pour y parvenir, une étude de cohorte de 1 000 donneurs sains a été réalisée, à partir de laquelle une base de données et une biocollection d’échantillons comprenant de l’ADN, de l’ARN, du plasma et des cellules, ont été établies. D’autres études cliniques sont prévues dans les années à venir pour étendre et tester nos observations initiales sur la variabilité immunitaire. L’équipe MI est basée sur la plateforme CBUtechS de l’Institut Pasteur et est une équipe multidisciplinaire de scientifiques, d’ingénieurs, de bioinformaticiens et d’un chef de projet qui travaillent en étroite collaboration avec les unités de recherche du consortium qui comprend des immunologistes, des microbiologistes et des généticiens.
Mission
Le projet Milieu Interieur ouvre un poste d’ingénieur de recherche (CDD-ODD de 3 ans) pour soutenir la gestion des échantillons, la génération et l’analyse des données de la cohorte Milieu Interieur et des études complementaires.
Principales activités:
– Gérer la biocollection d’échantillons existante pour de nouvelles études et la génération de nouvelles données
– Mettre en œuvre le traitement des échantillons pour les nouvelles études cliniques
– Participer aux études de séquençage de l’ARN, y compris à l’extraction d’ARN à haut débit, le contrôle qualité et le suivi des échantillons
– Participer à la réalisation et au suivi d’études du phénotypage à haut débit de plasma sur les échantillons de MI (spectrometrie de masse, analyses sérologiques), y compris à l’aliquotage et au contrôle qualité de ces échantillons.
– Générer des données à partie d’études cliniques (par exemple, Luminex/Nanostring technologies)
– Effectuer des analyses préliminaires à partir d’ensembles de données spécifiques
– Travailler avec l’équipe MI de la plate-forme CBUtech pour assurer les contrôles de qualité et la traçabilité nécessaires pour tous les échantillons et les données associés aux cohortes MI.
Exigences:
– Ingénieur de recherche avec un doctorat en sciences biologiques ou une expérience équivalente
– Expérience de travail avec des échantillons humains ou cliniques
– Expérience des technologies de biologie moléculaire (ARN et/ou protéine)
– Bonne organisation et bonne rigueur de travail indispensables
– Langue de travail: français/anglais
Envoyez un cv, une lettre de motivation et des références à darragh.duffy@pasteur.fr