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Événement

Prof. Frank NOE – “From all-atom molecular kinetics beyond the seconds timescale to cellular signal transduction”

Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date
19
Dec 2017
Heure
14:00:00
28 Rue du Docteur Roux, Paris, France
Address
Salle: Bâtiment RETROVIRUS LWOFF Salle 14-15 – RDC
Localisation
2017-12-19 14:00:00 2017-12-19 19:00:00 Europe/Paris Prof. Frank NOE – “From all-atom molecular kinetics beyond the seconds timescale to cellular signal transduction” Mardi 19 DECEMBRE 2017 à 14h00 Bâtiment RETROVIRUS LWOFF Salle 14-15 – RDC Prof. Frank NOE Freie Universität Berlin, Department for Mathematics  and Computer Science, Berlin, Germany “From all-atom molecular kinetics beyond the seconds […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France Guillaume Bouvier guillaume.bouvier@pasteur.fr

Présentation

Mardi 19 DECEMBRE 2017 à 14h00

Bâtiment RETROVIRUS LWOFF Salle 14-15 – RDC

Prof. Frank NOE

Freie Universität Berlin, Department for Mathematics

 and Computer Science, Berlin, Germany

“From all-atom molecular kinetics beyond the seconds timescale to cellular signal transduction”

This talk will describe recent method developments and results in bridging time- and lengthscales in the simulation of biophysical and biochemical systems:

1) A variational approach and Markov modeling can exploit extensive adaptive MD simulations to sample protein-protein association and dissociation in all-atom detail.

2) Multi-ensemble Markov models (MEMMs) can compute thermodynamics and kinetics of very rare events, going beyond the seconds timescale in all-atom protein dynamics.

3) Interacting-particle reaction-diffusion (iPRD) dynamics can model the interaction of macromolecules on cellular lengthscales to describe signal transduction processes.

 

Contact : Guillaume Bouvier  guillaume.bouvier@pasteur.fr   94 82

Unité de Bio-Informatique Structurale

 

Localisation

Salle: Bâtiment RETROVIRUS LWOFF Salle 14-15 – RDC
Address: 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France