Présentation

Un centre de référence international pour traiter, analyser et modéliser les données en biologie.

A l’heure où la biologie produit des masses de données considérables, la modélisation mathématique, les statistiques et l’informatique sont incontournables pour les comprendre. Le Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative (C3BI), créé en mars 2015, est la structure pluridisciplinaire et transversale de l’Institut Pasteur qui traite ces données à grande échelle.

Le C3BI facilite les collaborations et les échanges en bioinformatique au sein de l’Institut Pasteur. Il développe des recherches méthodologiques en informatique et statistique, apporte son soutien aux unités de recherche expérimentales, et travaille avec le Réseau international des Instituts Pasteur (RIIP). Ainsi, l’International Group for Data Analysis développe, dans le RIIP, les activités bioinformatique et la formation dans ce domaine.

 

Un espace de recherche

Le C3BI regroupe des équipes de scientifiques, en lien étroit avec les départements de l’Institut, dans des domaines de recherche très variés* :

Ainsi, un projet de recherche très ambitieux est coordonné par le C3BI : INCEPTION, pour INstitut Convergence : Emergence of Pathology Through Individuals and Populations. Sélectionné en 2016 par , il vise à comprendre et surveiller l’apparition de maladies dans les populations (contrôle des épidémies…) et chez les individus (médecine de précision…). Le C3BI propose de nouvelles méthodes bioinformatiques et biostatistiques pour comprendre et utiliser le foisonnement de données biologiques issu de la biologie expérimentale, de la santé publique ou celles fournies par les recherches cliniques.

Une plateforme de bioinformatique

« J’ai besoin de vous pour analyser les données que nous avons collectées. » Le C3BI répond à ces demandes provenant des équipes l’Institut Pasteur et de son réseau international : il effectue les analyses grâce à sa plateforme de bioinformatique, qui répond plus largement à toute question dans ce domaine. Avec une trentaine de chercheurs et d’ingénieurs recrutés en 2014-2016, l’analyse de données va pouvoir se faire à grande échelle. En 2018, un nouveau bâtiment de 120 places réunira les équipes du C3BI sur le campus de Paris.

La plateforme de bioinformatique de l’Institut Pasteur est un centre de référence, intégrée au réseau européen ELIXIR et à l’Institut français de bioinformatique.

Une offre de formation

Le C3BI forme un large public de biologistes, mathématiciens, informaticiens, statisticiens…, dans le cadre de la formation doctorale ou pour des scientifiques en poste. Par exemple, des formations sur l’analyse des données de séquences à haut débit ont été réalisées dans le Réseau international des Instituts Pasteur (à Montevideo, Dakar et Sao Paolo) et sur le campus parisien.

Pour en savoir plus sur le Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI) rendez vous sur notre site https://c3bi.pasteur.fr

“Jusqu’à la fin des années 90, la biologie se faisait devant des tubes à essai ou des boîtes de Petri. Maintenant, elle se pratique aussi bien derrière un ordinateur qu’à la paillasse. Et toutes les sciences biologiques sont concernées. L’Institut Pasteur investit ce domaine avec beaucoup d’énergie.”

Olivier Gascuel, directeur du Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative (C3BI)

 

Actualités

Événements

Ecole thématique – Bioinformatics of protein­-protein interactions for wet lab scientists

The course is intended for PhD students and postdocs working in experimental biology, but scientist of all levels are welcome. Participants will be introduced to a wide variety of popular bioinformatic tools aimed at […]

2017-04-03 09:00:00 2017-04-07 18:00:00 Europe/London Ecole thématique – Bioinformatics of protein­-protein interactions for wet lab scientists The course is intended for PhD students and postdocs working in experimental biology, but scientist of all levels are welcome. Participants will be introduced to a wide variety of popular bioinformatic tools aimed at […] 25 Rue du Docteur Roux, Paris, France

« Joint analysis of multiple phenotypes using GWAS summary statistics» by Hugues ASCHARD

Hugues Aschard P.I.  G5 Génétique Statistique « InBio » (C3BI) Institut Pasteur Genome-wide association studies (GWAS) have proven successful in identifying thousands of significant genetic associations for multiple traits and diseases. This success is largely thanks […]

2017-04-27 11:00:00 2017-04-27 00:30:00 Europe/London « Joint analysis of multiple phenotypes using GWAS summary statistics» by Hugues ASCHARD Hugues Aschard P.I.  G5 Génétique Statistique « InBio » (C3BI) Institut Pasteur Genome-wide association studies (GWAS) have proven successful in identifying thousands of significant genetic associations for multiple traits and diseases. This success is largely thanks […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread of Ebola, Diphtheria, Tuberculosis, Influenza and HIV

Tanja Stadler will talk about Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread of Ebola, Diphtheria, Tuberculosis, Influenza and HIV Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread […]

2017-05-18 14:00:00 2017-05-18 Europe/London Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread of Ebola, Diphtheria, Tuberculosis, Influenza and HIV Tanja Stadler will talk about Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread of Ebola, Diphtheria, Tuberculosis, Influenza and HIV Pathogen dynamics through a phylogenetic lens – zooming into the spread […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis

Julien Gagneur will talk about Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis. Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis Registration Apply here

2017-06-01 14:00:00 2017-06-01 Europe/London Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis Julien Gagneur will talk about Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis. Genetic basis of gene regulation: genome-wide models and applications to diagnosis Registration Apply here Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Between chaos and determinism: the evolution of stochastic gene expression

Julien Dutheil will talk about Between chaos and determinism: the evolution of stochastic gene expression While often depicted as finely tuned programs, biochemical processes in the cell are subject to random fluctuations because of […]

2017-06-15 14:00:00 2017-06-15 16:00:00 Europe/London Between chaos and determinism: the evolution of stochastic gene expression Julien Dutheil will talk about Between chaos and determinism: the evolution of stochastic gene expression While often depicted as finely tuned programs, biochemical processes in the cell are subject to random fluctuations because of […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

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