Présentation

Un centre de référence international pour traiter, analyser et modéliser les données en biologie.

A l’heure où la biologie produit des masses de données considérables, la modélisation mathématique, les statistiques et l’informatique sont incontournables pour les comprendre. Le Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative (C3BI), créé en mars 2015, est la structure pluridisciplinaire et transversale de l’Institut Pasteur qui traite ces données à grande échelle.

Le C3BI facilite les collaborations et les échanges en bioinformatique au sein de l’Institut Pasteur. Il développe des recherches méthodologiques en informatique et statistique, apporte son soutien aux unités de recherche expérimentales, et travaille avec le Réseau international des Instituts Pasteur (RIIP). Ainsi, l’International Group for Data Analysis développe, dans le RIIP, les activités bioinformatique et la formation dans ce domaine.

 

Un espace de recherche

Le C3BI regroupe des équipes de scientifiques, en lien étroit avec les départements de l’Institut, dans des domaines de recherche très variés* :

Ainsi, un projet de recherche très ambitieux est coordonné par le C3BI : INCEPTION, pour INstitut Convergence : Emergence of Pathology Through Individuals and Populations. Sélectionné en 2016 par , il vise à comprendre et surveiller l’apparition de maladies dans les populations (contrôle des épidémies…) et chez les individus (médecine de précision…). Le C3BI propose de nouvelles méthodes bioinformatiques et biostatistiques pour comprendre et utiliser le foisonnement de données biologiques issu de la biologie expérimentale, de la santé publique ou celles fournies par les recherches cliniques.

Une plateforme de bioinformatique

« J’ai besoin de vous pour analyser les données que nous avons collectées. » Le C3BI répond à ces demandes provenant des équipes l’Institut Pasteur et de son réseau international : il effectue les analyses grâce à sa plateforme de bioinformatique, qui répond plus largement à toute question dans ce domaine. Avec une trentaine de chercheurs et d’ingénieurs recrutés en 2014-2016, l’analyse de données va pouvoir se faire à grande échelle. En 2018, un nouveau bâtiment de 120 places réunira les équipes du C3BI sur le campus de Paris.

La plateforme de bioinformatique de l’Institut Pasteur est un centre de référence, intégrée au réseau européen ELIXIR et à l’Institut français de bioinformatique.

Une offre de formation

Le C3BI forme un large public de biologistes, mathématiciens, informaticiens, statisticiens…, dans le cadre de la formation doctorale ou pour des scientifiques en poste. Par exemple, des formations sur l’analyse des données de séquences à haut débit ont été réalisées dans le Réseau international des Instituts Pasteur (à Montevideo, Dakar et Sao Paolo) et sur le campus parisien.

Pour en savoir plus sur le Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI) rendez vous sur notre site https://c3bi.pasteur.fr

“Jusqu’à la fin des années 90, la biologie se faisait devant des tubes à essai ou des boîtes de Petri. Maintenant, elle se pratique aussi bien derrière un ordinateur qu’à la paillasse. Et toutes les sciences biologiques sont concernées. L’Institut Pasteur investit ce domaine avec beaucoup d’énergie.”

Olivier Gascuel, directeur du Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative (C3BI)

 

Actualités

Événements

Ecole thématique – Bioinformatics of protein­-protein interactions for wet lab scientists

Bâtiment: Lwoff – Salle: 14-15 – Address: 25 Rue du Docteur Roux, Paris, France
2017-04-03 09:00:00 2017-04-07 18:00:00 Europe/Paris Ecole thématique – Bioinformatics of protein­-protein interactions for wet lab scientists The course is intended for PhD students and postdocs working in experimental biology, but scientist of all levels are welcome. Participants will be introduced to a wide variety of popular bioinformatic tools aimed at […] 25 Rue du Docteur Roux, Paris, France

C3BI Seminar – Emergence of de novo protein coding genes from ‘dark genomic matter’ — fact or fiction?

Bâtiment: Batiment François Jacob – Salle: Amphitheatre François Jacob – Address: Institut Pasteur, Paris, France
2017-09-06 14:00:00 2017-09-06 15:00:00 Europe/Paris C3BI Seminar – Emergence of de novo protein coding genes from ‘dark genomic matter’ — fact or fiction? EMERGENCE OF DE NOVO PROTEIN CODING GENES FROM ‘DARK GENOMIC MATTER’ — FACT OR FICTION?  Main speaker : Erich Bornberg-Bauer, from Institute for Evolution and Biodiversity, The Westfalian Wilhelms University of Muenster, Germany  Date : 06/09/2017 […] Institut Pasteur, Paris, France

C3BI Seminar – Linking gene and function by integrated approaches: how to improve the poor annotation status of sequenced genomes

Bâtiment: Batiment François Jacob – Salle: Amphitheatre François Jacob – Address: Institut Pasteur, Paris, France
2017-09-07 14:00:00 2017-09-07 15:00:00 Europe/Paris C3BI Seminar – Linking gene and function by integrated approaches: how to improve the poor annotation status of sequenced genomes LINKING GENE AND FUNCTION BY INTEGRATED APPROACHES: HOW TO IMPROVE THE POOR ANNOTATION STATUS OF SEQUENCED GENOMES  Main speaker : Valérie de Crécy-Lagard, from Professor University of Florida – Department of Microbiology and Cell Science […] Institut Pasteur, Paris, France

C3BI Seminar – Eugene Myers – Computer Vision & Computational Optics for Bioimage Informatics

Bâtiment: Batiment François Jacob – Salle: Amphitheatre François Jacob – Address: Institut Pasteur, Paris, France
2017-09-21 14:00:00 2017-09-21 15:00:00 Europe/Paris C3BI Seminar – Eugene Myers – Computer Vision & Computational Optics for Bioimage Informatics Computer Vision & Computational Optics for Bioimage Informatics   Eugene “Gene” Myers: Best known for contributing to the early development of the BLAST tool for sequence analysis. His 1990 paper (with Stephen Altschul and others) […] Institut Pasteur, Paris, France

Workshop “Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)” 2017

Bâtiment: Bat F. Jacob – Salle: Auditorium F. Jacob – Address: 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France
2017-10-09 00:00:00 2017-10-10 18:00:00 Europe/Paris Workshop “Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)” 2017 OBJECTIVES ————— This workshop aims at promoting discussions and collaborations between biologists (modelers),  computer scientists and applied-mathematicians involved in metagenomics and/or metatranscriptomics studies, either in the bioinformatics or statistical aspects of such analysis. Metagenomics  […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

The molecular anatomy of the human body

Bâtiment: Centre François Jacob – Salle: Auditorium, Rdc – Address: 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France
2018-01-11 14:00:00 2018-01-11 15:00:00 Europe/Paris The molecular anatomy of the human body The relationship between the transcriptomes of tissues and the transcriptomes of the constituent primary cells, and how these impact tissue phenotypes has not been well established. Here we have produced RNA sequencing data for […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

C3BI Seminar – Inferring causality in complex molecular pathways from live cell movies, by Prof. Gaudenz Danuser

Bâtiment: Lwoff – Salle: Retrovirus – Address: Institut Pasteur, Paris, France
2018-02-22 14:00:00 2018-02-22 15:00:00 Europe/Paris C3BI Seminar – Inferring causality in complex molecular pathways from live cell movies, by Prof. Gaudenz Danuser One of the major limitations in the study of complex molecular pathways is adaptation of the system to experimental perturbation. With ‘complex’ we mean pathways with a significant level of functional redundancy between components […] Institut Pasteur, Paris, France

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